* В аркадной версии, после 250 матчей в режиме двух игроков открывается возможность игры в клон классической аркады Pong.
* Если сразу после сбрасывания противника в кислоту на арене The Dead Pool, держать на джойстике «↓», раздастся фраза «Oh, maw».
* Нажав на джойстике «↓» во время демонстрации поединков, можно увидеть список из 15 лучших игроков игры.
* В сервисном меню игры находится строка Kano Transformation. Из-за этой строки появились слухи, что в игре существует возможность перевоплощения Шанг Тсунга в Кано. Mortal Kombat II получил известность также во многом благодаря своим секретам. Возможно, разработчики специально ввели такую строку в игру дабы игроки начали искать секретных бойцов.