Сега Генезис / Мега Драйв Ultimate Mortal Kombat 3
Из-за ограниченных возможностей приставки графика и звук в этой версии хуже, чем в Ultimate Mortal Kombat 3 на СНЕС. Как и в версии для СНЕС Рейн и Нуб-сайбот доступны для игры. Мотаро и Шао Кана можно выбрать в режиме игры для двух игроков, используя секретные опции. Милина, Ермак и Классический Саб-Зиро открыты для игры без введения кодов. Бруталити также включены в эту версию. Шанг Цунг может превращаться в Смоука-киборга, Рейна и Нуб-сайбота, что невозможно в аркадной игре. В этой версии также есть миниигра Понг, названная МК4, которая уже появлялась в МК3 на Сеге Генезис.
Из-за нехватки места на картридже некоторые элементы игры были убраны. Полностью убраны Анималити, причем в секретных опциях, открывающихся с помощью кодов, при выборе функции «Добивание с одного удара» Animality присутствует в списке. Сокровища Шао Кана состоят из десяти ячеек, а не из двенадцати. Шао Кан больше не произносит имена бойцов. Некоторые уровни из МК3 отсутствуют, например Балкон и Улица, поэтому делая апперкот на аренах Метро и Палата Душ противник никуда не вылетает. При этом, если вызвать кодовое меню с помощью специального чит-кода, в звуковом тесте игры можно услышать фоновую музыку одного из отсутствующих уровней игры, которую забыли убрать разработчики. Хотя уровень Колокольня убран, фоновое Фаталити от этой арены все ещё существует в коде игры и может быть выполнено. Режим на Выносливость (Endurance Mode) тоже остался в коде и доступ к нему можно получить с помощью Game Genie. Также в игре есть незаконченная версия Хамелиона, бойца, который впервые в законченном виде появился только в МКТ для PS1 и PC. Соня использует версию Френдшипа из МК3. Одно из Фаталити Скорпиона отличается от того, что было в аркадной версии игры — вместо, чтобы призывать армию своих двойников, Скорпион переносит противника на уровень Логово Скорпиона, где тот загорается и взрывается. У Смоука-Человека те же комбо, что и у Скорпиона.