Сюжет в игре тот же самый, что был и в Mortal Kombat 3. Разница лишь в том, что было добавлено несколько новых персонажей и сюжетных линий.
Ultimate Mortal Kombat 3 — это игра жанра файтинг из серии Mortal Kombat, которая была выпущена на аркадных игровых автоматах в 1995 году. Это — апдейт игры Mortal Kombat 3, который тоже потом был переделан в Mortal Kombat Trilogy. Мидвей выпустила также версию этой игры для сети X-Box Live на приставке Xbox 360 и на Nintendo DS. Почти полностью совпадающая с аркадной версия игры была включена в Премиум Издание Mortal Kombat: Armageddon для PS2.